Машина оборудована зенитной пулеметной установкой закрытого типа и грузовой платформой для перевозки катковых секций трала КМТ-7.
Для их погрузки и разгрузки на машине смонтирован ручной грузоподъемный кран.
В комплект оборудования входят средства обеспечения деятельности саперного десанта по ручному разминированию местности.
Бронированная машина разминирования БМР-3МC предназначена для обеспечения проводки техники и проделывания проходов на заминированных участках местности с обеспечением траления основных типов противотанковых, противогусеничных и противоднищевых мин с контактными механическими, неконтактными магнитными взрывателями путем использования навесного тралящего оборудования.
На БМР-3МС может устанавливаться комбинированный колейный минный трал КМТ-7 катково-ножевого типа, обеспечивающий две протраленные колеи по 0,8 м, или инженерный танковый минный трал ТМТ-С, обеспечивающий сплошное разминирование местности шириной 3,9 м. При использовании минного трала ТМТ-С дополнительно обеспечивается траление противобортовых мин с неконтактными сейсмооптическими взрывателями, а также разрушение проводных линий управления взрывом мин, фугасов.